Obec připomínaná v roce 1366 v souvislosti s mýtem. Utrpěly za války Jiřího z Poděbrad s Matyášem Korvínem. Význam městečka vzrostl po roce 1840, kdy byla v blízkosti vybudována tzv. Severní Ferdinandova dráha, tj. trať Břeclav - Přerov. Povýšeny na město až roku 1898. Ve 20. století proběhla rozsáhlá industrializace - továrna na motory Slavia ČKD a továrna na výrobu pryžového zboží a plastických hmot Fatra. V Napajedlích je vyhlášena Městská památková zóna. Farní kostel sv. Bartoloměje se sochami sv. Petra a Pavla, který byl vystavěn v letech 1710-1712. Při schodišti ke kostelu se nachází řada soch: sv. Cyrila, sv. Jana, sv. Ludmily, sv. Metoděje a sv. Václava. K zámeckému parku přiléhá dodnes zachovalý komplex původních stájí hřebčína. Konají se zde dražby ročků, na které se sjíždějí chovatelé z celého světa. Dnes je hřebčín nejvýznamnějším producentem dostihových koní v České republice (kolem 60 hříbat ročně). Za továrními budovami Fatry se dochovala část budovy minerálních lázní, která dnes slouží jako inhalatorium. První zmínky o léčivých vodách pocházejí ze 16. století, při stavbě železnice v 19. století se však část pramenů ztratila. Jeden z pramenů je vyveden na povrch a je hojně využíván k pití a vaření. Barokní zámek z poloviny 18. století (arch. F. A. Grimm), který byl v r. 1945 zkonfiskován a v 50. letech z větší části zničen a vnitřní zařízení rozprodáno. Není veřejnosti přístupný. Chloubou a místem odpočinku je však zámecký park (chráněné přírodní území), který byl založen v 70. letech 18. století v anglickém stylu. Šlechtičtí majitelé v něm nechali vysadit množství vzácných dřevin. Uprostřed je malý rybníček. Ve zbytku hospodářských budov a skleníků je dnes Klub kultury, loutkové divadlo, sportoviště a tenisové kurty.