V roce 1341 drželi Kunovice Štěpán a Oldřich z Ungersberka (ze Sádku) a psali se po nich. Ti zde vybudovali tvrz, připomínanou poprvé v roce 1354. Majitelé zboží se pak často střídali, až je v roce 1497 získal Mikuláš Hrdý z Klokočné a pak Bohuš ze Zvole. V době nebezpečí tureckých válek byla tvrz opevněna a opatřena střílnami. V roce 1566 se Kunovičtí vzbouřili proti útlaku Bohušova syna Václava ze Zvole a zabili jej. Jeho syn Vilém Fridrich prodal v roce 1610 statek spolu s tvrzí Janu Jetřichovi z Kunovic za 49 000 kop gr. míšeňských a od té doby náležely Kunovice k ostrožskému panství.
      V ostrožském urbáři z roku 1592 je tvrz uváděna jako zámek, obklopený vodním příkopem, v němž se pěstovali kapři. Po Bílé hoře přešly Kunovice jako součást ostrožského panství do majetku Lichtenštejnů, kteří přeměnili dosavadní tvrz ve vrchnostenský dvůr, takže dnes se po tvrzi nezachovaly žádné stopy.